Genetiker har avkodat genomet av pestbacillusen, en bakterie som förstörde Europa på 1300-talet. Det visade sig att den dödliga peststickan nästan inte kan skiljas från sin ofarliga "mormor"
I augusti 2011 erhöll forskare från universitet i USA, Tyskland och Kanada, under ledning av Johannes Krause vid universitetet i Tuebingen, de första deluppgifterna om DNA från pesten bacillus Yersinia pestis, som dödade 30 miljoner människor under en femårsperiod på 1300-talet. … För att göra detta studerade genetiker ben och tänder hos pestoffer som begravdes 1348 på Londons East Smithfield Cemetery.
I ett papper i augusti återvände forskare cirkulärt DNA som ligger utanför kromosomerna och som behövs av bakterier för att syntetisera proteiner som undertrycker människans immunitet. Denna DNA - plasmid pPCP1 - biologer jämförde med liknande delar av genomet i moderna peststickor, varefter de kom till slutsatsen att pestbacillusen under XIV-talet dog ut och lämnade inga ättlingar.
I den senaste studien, vars resultat dök upp i naturen, använde Dr. Krause och hans kollegor en redan etablerad teknik för att sätta ihop det kompletta genomet Yersinia pestis.
De valde flera välbevarade tänder från East Smithfield-gravar. Resterna av bakteriegenomet hittades på tändernas kronor och rötter. Pusslet med fyra miljoner nukleotider av genetik samlades med hjälp av ett datorprogram.
Som forskarna noterar är noggrannheten att avkoda Yersinia pestis-genomet hög - jämförbar med noggrannheten för att avkoda det mänskliga genomet.
Det är riktigt, i genomet till den dödliga bakterien finns det fortfarande vita fläckar: biologer har återställt 93,5% av det genetiska "pusslet" - de återstående delarna har upplösts i massgraven i East Smithfield.
Mormor till svartedöden
Dr. Krauses team jämförde strukturen för det resulterande DNA med genomet till den moderna pestbacillusen (stam CO92). Det visade sig att de flesta generna i kromosomer och plasmider sammanfaller, men vissa regioner är antingen helt frånvarande i moderna bakterier eller ersätts av andra DNA-sekvenser.
Kampanjvideo:
I genomet av en medeltida bakterie har forskare också upptäckt gener som kombinerar de äldsta stammarna av Yersinia pestis med deras gemensamma förfader, bakterien Yersinia pseudotuberculosis.
"Detta indikerar att genomet av Yersinia pestis har förändrats lite under de senaste 600 åren, trots flera epidemier och aktiva personers kamppatogener," - säger forskare och sammanfattar resultaten av den jämförande analysen.
