Fyndet förnyade debatten om jättevirus plats på det evolutionära trädet. Är dessa virus eller levande celler som har tappat förmågan att reproducera självständigt?
Österrikiska mikrobiologer har upptäckt ett virus som sticker ut från sina släktingar i enhetens storlek och komplexitet. "Rekordhållaren", som finns i avloppsvattnet i staden Klosterneuburg i östra Österrike, har en diameter på cirka 400 nanometer och en genomstorlek på 1570 tusen baspar (355 gener). För att hedra platsen för upptäckten fick viruset namnet Klosneuvirus. Fyndet rapporteras av Science magazine.
Viruset upptäcktes med hjälp av en arsenal av metagenomiska metoder. Enkelt uttryckt samlades virusets genom bit för bit från de fragment som hittades i de tagna proverna. Detta tillvägagångssätt gör det möjligt för forskare att studera uppsättningen gener av alla mikroorganismer som finns i provmiljön utan att de odlas i laboratoriet. Författarna till arbetet bedömer själva fyndet som ett fullbordat faktum och rapporterar den troliga upptäckten av tre besläktade arter i det närliggande området.
Upptäckten gav upphov till debatten om huruvida de jättevirus som har upptäckts periodiskt under det senaste decenniet är virus i ordets strikta bemärkelse, eller om vi har tidigare levande celler som en gång blev parasiter och förlorade en hel del genetisk information tillsammans med dessa anpassningar på en lång evolutionär väg, som kodade "kasseras". I det här fallet verkar det logiskt att separera dem i en separat domän, lika med bakterier, eukaryoter och archaea.
Storlekar på några kända virus: Poliomyelitvirus ~ 30 nm. Zika-virus ~ 45 nm. Adenovirus ~ 90 nm. HIV-1 ~ 120 nm. Mimivirus ~ 400 nm
Faktum är att de flesta virus är mycket mindre än cellerna som de invaderar i och har en mycket blygsam storlek på genetiskt material. Vissa typer av fågel- och svinvirus kostar bara två gener att reproducera, mot tusentals till och med en vanlig bakterie. Till exempel innehåller den välkända E. coli 4400 gener - och detta är inte ett register ännu. Kända jättevirus (det första upptäcktes 2003 och ungefär ett halvt dussin av dem har beskrivits totalt) innehåller cirka ett till två tusen gener vardera, vilket klart överstiger det minsta antal som krävs för att "fånga" en cell och dess efterföljande användning. Vissa organismer, uppenbarligen kapabla till självständigt liv och reproduktion, kostar mindre.
Skeptiker ser inte behovet av den fjärde domänen, vilket förklarar den genetiska redundansen hos jättevirus genom att låna värdmaterial. Till exempel kallar Evgeny Kunin (National Center for Biotechnology Information, Bethesda, Maryland) det "kristallklart" att jättevirus tillhör grupper som innehåller mycket mindre former. I allmänhet är författarna till upptäckten själva benägna till denna synvinkel. I samarbete med kollegor visade de att jättevirus gradvis lånade genetiskt material från olika värdar. "Det finns inga bevis för en fjärde domän, och detta dokument bekräftar det", säger Curtis Suttle, en virolog vid University of British Columbia i Vancouver, Kanada.
Dessutom ifrågasätter skeptiker själva upptäckten. Mikrobiolog Didier Raoult vid University of Marseille konstaterar att det skulle vara trevligt att se dess ägare innan man drar slutsatser om evolutionen från genomet. Generens sekvens är ett mindre argument: de byter ofta platser och genomgår andra förändringar som döljer deras ursprung.
Kampanjvideo:
Sergey Sysoev
