Forskare i USA och Storbritannien har utvecklat en metod för att bestämma människors biologiska ålder av tarmens mikroflora. Information om biologisk ålder kan användas för att förhindra en för tidig död om en analys avslöjar varningstecken. Resultaten av vetenskapligt arbete publiceras i bioRxiv-förtrycksförvaret.
Kolonier av bakterier lever i den mänskliga tarmen, antalet celler i vilket når 10 till den 14: e kraften, vilket är ungefär en storleksordning högre än antalet celler i själva kroppen. Det är känt att mikroflora spelar en viktig roll i bildandet av immunitet, producerar ämnen viktiga för nervsystemet och påverkar också åldringsprocessen. Eftersom tarmmikrobiomets sammansättning förändras under livets gång är det svårt att avgöra vilka bakterier som är förknippade med risken för vissa sjukdomar och åldrande.
Den nya studien omfattade 1 165 personer mellan 20-90 och 3 663 prover av deras tarmmikrobiom. Biologer har bestämt mikrofloraens sammansättning i båda fallen och kopplat den till frivilligernas biologiska ålder. De erhållna data, inklusive egenskaperna hos varje typ av mikroorganism, användes för djup inlärning av ett neuralt nätverk bestående av tre dolda lager med 512 noder i vardera, bearbetning av inkommande information. Som en träningssats användes 90 procent av proverna, resten användes för verifiering.
Testning har visat att det tränade nervnätverket förutspådde en persons ålder baserat på sammansättningen av hans mikroflora med ett fel på 3,94 år. Ytterligare analys visade att 39 taxa av mikroorganismer bestämmer en persons biologiska ålder.
Det visade sig att åldrande har lite att göra med förekomsten av gynnsamma eller skadliga bakterier i tarmen. Till exempel minskade antalet celler i den patogena mikroorganismen Campylobacter jejuni, som orsakar diarré med åldern, medan arten av släktet Eubacterium, som är användbart för människor, tvärtom ökade antalet. Dessutom bidrar mikroorganismer som är vanliga hos äldre inte nödvändigtvis till åldrande och utveckling av åldersrelaterade sjukdomar.
