Deltagare i Genome 10K-konsortiet vid den årliga konferensen, som nu äger rum i New York, meddelade lanseringen av det internationella projektet "Vertebrate Genomes", dess uppgift är att samla genomerna för alla 66 tusen ryggradsdjur som lever på planeten idag. Gizmodo berättar mer om projektets mål och mål.
2009 grundade amerikanska biologer David Haussler, Oliver Ryder och Stephen O'Brien projektet Genome 10K, vars mål var att sekvensera 10 000 ryggradsgenom. Inledningsvis deltog 55 forskare från stora djurparker, forskningscentra och museer i projektet. Först var det oklart hur lång tid det skulle ta att samla genom av tillräcklig kvalitet. Men med kostnaden och förenklingen av sekvenseringsmetoder blev det klart att projektet skulle slutföra sina uppgifter om några år. Under de senaste tre åren har projektdeltagarna jämfört de viktigaste teknologierna för DNA-sekvensering och analys av de resultat som erhållits för att välja den som skapar "platina-genom".
Igår tillkännagav Genome 10K-medlemmar lanseringen av ett nytt Vertebrate Genome Project, som syftar till att samla manliga och kvinnliga genom från 66 000 ryggradsdjur. Projektet kommer att involvera 150 forskare som representerar 50 organisationer från 12 länder. Enligt en av grundarna av projektet, Oliver Ryder, kommer biologer som ett resultat att kunna förstå orsakerna till utrotningen av arter, inklusive om det har funnits nära besläktade korsningar i artens historia, "flaskhalsar", som ett resultat av att den genetiska mångfalden hos en art har minskat eller raderingar - mutationer som kan "stänga av »Gener som är nödvändiga för att organismen ska överleva.
Tillsammans med tillkännagivandet av det nya projektet presenterade forskare omedelbart de första resultaten av sitt arbete: genomerna hos 15 ryggradsdjur, inklusive den utrotningshotade kakapo-papegojan, endemisk mot Nya Zeeland och den australiska näbbdjuret. Dessa och alla andra genom som forskarna planerar att samla kommer att publiceras i det offentliga området, i Noahs Ark Genomic-databas.
Deltagarna planerar att sekvensera korta sektioner av genomiskt DNA och samla allt längre sekvenser från dem upp till hela kromosomen och sedan "limma" dem med algoritmer som är särskilt utvecklade för projektet.
Tidigare kunde forskare läsa en persons genom på en smartphone-storlek pocket sequencer. Enheten satte rekord för den längsta avläsningen av en DNA-molekyl, den kunde sekvensera sekvenser upp till 882 tusen baspar.
Ekaterina Rusakova
