Amerikanska forskare, tillsammans med kollegor från Ryssland, har bekräftat att ett bakterieprotein, som tidigare antogs kunna redigera RNA (ribonukleinsyra), i själva verket kan användas som ett verktyg för att modifiera genomet, liknande CRISPR / Cas9-tekniken. Artikeln publicerades i tidskriften Science.
Cirka hälften av alla bakterier har en slags analog immunsystemet, kallad CRISPR / Cas9, som skyddar dem från virus. Systemet består av gener som kodar för Cas-proteiner som skär främmande gener, såväl som av korta repetitiva DNA-sekvenser separerade av unika regioner - distanser. Spacers kodar olika typer av guide-RNA, en molekyl som känner igen specifika virala gensekvenser och riktar Cas att göra dem ofarliga.
Det finns många typer av CRISPR / Cas9, som kännetecknas av olika Cas9-proteiner. Tidigare beskrev forskare C2c2-proteinet, som inte innehåller regioner som utför en nukleasfunktion, med andra ord skuren DNA. Forskarna föreslog att proteinet riktar sig till RNA.
En serie experiment har bevisat att C2c2 verkligen kan kliva enkelsträngat RNA. Denna förmåga hos proteinet gör att CRISPR-systemet kan användas för att slå ut - undertrycka funktioner - av bakteriell messenger RNA, som överför information från gener till ribosomer, där proteiner syntetiseras på grundval av detta. Forskare testade förmågan hos C2c2 att binda till specifika regioner av Escherichia coli RNA och visade att proteinet inte bara binder till RNA utan också stör sin sekvens.
Enligt författarna till verket finns det troligtvis andra system som riktar sig till RNA. I framtiden planerar forskare att utveckla anpassningsbara molekylära verktyg för att manipulera viralt, bakteriellt och till och med mänskligt RNA.
